Yenidoğan yoğun bakım ünitesinde el hijyeni uyumu ve enfeksiyon epidemiyolojisine etkisi
Marmara Üniversitesi
- Yazar
- Gamze Alçi
- Danışman
- Prof. Dr. Ayşegül Karahasan
- Yer bilgisi
- Marmara Üniversitesi · Mikrobiyoloji Anabilim Dalı
- Tez numarası
- 528546
Bilimsel merakı iyi tasarlanmış veriyle buluşturuyorum. Tıbbi mikrobiyoloji geçmişimi; güvenilir, izlenebilir ve anlamlı klinik araştırma verilerine dönüştürüyorum.
Hakkımda
Bilim laboratuvarda doğar — ama güvenilir olduğu yer veridir. Ben tam da bu buluşma noktasında çalışıyorum.
Edirne'de doğdum; ancak çocukluğum tek bir şehre ait olmadı. Asker bir babanın kızı olarak Türkiye’nin farklı şehirlerinde, her defasında yeni bir okula, yeni insanlara ve yeni bir çevreye alışarak büyüdüm. O yıllarda yalnızca yeni yerlere uyum sağlamayı öğrendiğimi düşünüyordum. Bugün geriye baktığımda ise çocukluğumun bana bir araştırmacının belki de en çok ihtiyaç duyduğu iki özelliği kazandırdığını görüyorum: yabancı olana çekinmeden yaklaşma cesareti ve karşılaştığım her yeni dünyayı anlamaya çalışan dinmeyen bir merak.
Zamanla bu merakın yönü bilime döndü. Moleküler biyoloji ve genetik eğitimi, canlılığı yalnızca gözlemlemek yerine onun ardındaki mekanizmaları anlamaya çalıştığım ilk alan oldu. Lisans yıllarım boyunca genlerin, proteinlerin ve hücrelerin kendilerine özgü dilini okumayı öğrenirken bilimin yalnızca laboratuvar sınırları içinde yaşamadığını da keşfettim. BÜBAK öğrenci kulübünü kurarak akademik etkinlikler düzenledim, Erasmus+ programıyla Polonya’da eğitim aldım; TEMA, HAYTAP ve Toplum Gönüllüleri Vakfı’ndaki çalışmalarım sayesinde ise farklı insanlarla ortak bir amaç etrafında buluşmanın değerini deneyimledim. Bütün bunlar bana ekip kurmayı, sorumluluk üstlenmeyi ve bilimsel bilgiyi farklı dünyalarla buluşturmayı öğretti.
Bilimsel merakımın insan sağlığıyla daha doğrudan kesiştiği yer ise tıbbi mikrobiyoloji oldu. Yüksek lisans ve ardından doktora çalışmalarım boyunca antimikrobiyal direnç, biyofilmler ve bakteriyofajlar üzerine yoğunlaştım. Kistik fibrozisli hastalarda Pseudomonas aeruginosa epidemiyolojisinden çok ilaca dirençli bakterilere karşı fajların antibiyofilm etkisine; Candida türlerinin antifungal duyarlılığından hastane enfeksiyonları ve el hijyenine uzanan farklı araştırmalarda yer aldım.
Konular değişse de karşıma çıkan temel soru aslında hep aynıydı: Bir bilimsel sonuca ne kadar güvenebiliriz?
Bu soru, zamanla kariyerimin yönünü belirleyen soruya dönüştü. Çünkü laboratuvarda üretilen bir bulgunun değerinin yalnızca bilimsel olarak ilgi çekici olmasına değil, onu taşıyan verinin doğruluğuna, bütünlüğüne ve izlenebilirliğine bağlı olduğunu gördüm. Bir başka deyişle, bilimsel hikâyenin güvenilirliği onu oluşturan en küçük veri noktasına kadar uzanıyordu.
Böylece mikroskobun başında başlayan merakım, bilimsel kaydın nasıl tasarlandığını, korunduğunu ve anlamlı bir bütüne dönüştürüldüğünü anlamaya yöneldi. Klinik veri yönetimine geçişim benim için bilimden uzaklaşmak değil, bilimin başka bir katmanına yaklaşmak oldu. Mikrobiyoloji geçmişim sayesinde bugün bir laboratuvar sonucunu yalnızca bir değer olarak değil klinik bağlamıyla; bir advers olayı yalnızca bir kayıt olarak değil taşıdığı anlamla; tek bir hasta verisini ise büyük bir veri setinin küçük bir parçası olmanın ötesinde, gerçek bir insanın hikâyesinin bilimsel kaydı olarak okuyabiliyorum.
2019’dan bu yana MonitorCRO bünyesinde 100’ü aşkın klinik çalışmada, verinin planlanmasından nihai raporlamaya uzanan yolculuğunun farklı aşamalarında görev alıyorum. Yaptığım işin merkezinde ilk bakışta oldukça teknik görünen bir sorumluluk var: Bir ilacın ya da tedavinin insanlar üzerindeki etkisini anlatan verinin doğru, eksiksiz, tutarlı ve kaynağına kadar izlenebilir olmasını sağlamak. Ancak benim için klinik veri yönetiminin anlamı teknik tanımının ötesinde. Çünkü her satırın, her sorgunun ve her veri noktasının sonunda gerçek hastalar; bu verilere dayanılarak verilecek gerçek bilimsel ve klinik kararlar bulunuyor.
2024 yılında tamamladığım Tıbbi Mikrobiyoloji doktorası, araştırmacı kimliğimi güçlendirirken klinik veriyi bilimsel bağlamı içinde değerlendirme biçimimi de derinleştirdi. Doktora sürecinde ORPHEUS Türkiye öğrenci temsilcisi olarak üstlendiğim görev ise bilimin yalnızca bireysel araştırmalardan değil, araştırmacıları birbirine bağlayan akademik kültürden de beslendiğini görmemi sağladı.
Bugün mesleki yolculuğuma baktığımda, çocukluğumdan beri taşıdığım o merakın aslında hiç kaybolmadığını görüyorum; yalnızca biçim değiştirdi. Bir zamanlar yeni bir şehri ve yeni insanları anlamaya çalışırken, ardından mikroskobun altında mikroorganizmaların dünyasını çözmeye çalıştım. Bugün ise aynı merakla klinik araştırmaların ardındaki veriyi okuyorum.
Kendimi tam da bu nedenle bilimin merakı ile verinin disiplini arasındaki kesişimde tanımlıyorum. Yaptığım iş çoğu zaman araştırmanın en görünür kısmı olmayabilir. Fakat bir bilimsel sonucun güvenilir olabilmesi için arkasındaki verinin de aynı ölçüde güvenilir olması gerekir.
Belki de mesleğimde en çok değer verdiğim şey tam olarak budur: Bir araştırmanın güvenilirliğini, çoğu zaman görünmeden ama her zaman titizlikle ayakta tutmak.
Çalışma alanlarım ve araçlarım
Klinik veri yönetimiAntimikrobiyal dirençBiyofilm ve bakteriyofaj araştırmalarıKlinik Veri Değişim Standartları Konsorsiyumu (CDISC) ve Çalışma Verisi Tabülasyon Modeli (SDTM)Düzenleyici Faaliyetler için Tıbbi Sözlük (MedDRA) ve UMC İlaç Sözlüğü (WHODrug Global)IBM Sosyal Bilimler için İstatistik Paketi (SPSS), Stata ve GraphPad PrismTıbbi mikrobiyoloji, dünyaya baktığım bilimsel merceği oluşturuyor. Doktora çalışmalarım boyunca enfeksiyon hastalıkları, antimikrobiyal direnç, biyofilm ve bakteriyofaj araştırmaları üzerine yoğunlaştım. Bu bilimsel altyapı, bugün klinik araştırma verilerini yalnızca sayılardan oluşan bir tablo olarak değil; hastaların tedavi sürecini ve araştırmanın güvenilirliğini açıklayan bir bütün olarak değerlendirmemi sağlıyor.
Klinik araştırmalar; yeni bir ilacın, tedavinin veya tıbbi yaklaşımın insanlarda ne kadar etkili ve güvenli olduğunu anlamak için yürütülür. Araştırma boyunca hastaların sağlık durumu, uygulanan tedaviler, laboratuvar sonuçları, eş zamanlı kullanılan ilaçlar ve ortaya çıkan yan etkiler düzenli biçimde kaydedilir. Klinik veri yönetimi, farklı hastane ve araştırma merkezlerinden gelen bu bilgilerin doğru, eksiksiz, tutarlı ve gerektiğinde kaynağına kadar izlenebilir olmasını sağlayan disiplindir.
Klinik Veri Yöneticisi olarak araştırma başlamadan önce hangi bilgilerin nasıl toplanacağını planlıyor, elektronik hasta veri formlarını ve çalışma veri tabanını oluşturuyor, sistemin doğru çalıştığını kullanıcı bakış açısıyla test ediyorum. Araştırma sürerken verileri düzenli olarak kontrol ediyor; eksik, çelişkili veya olağan dışı kayıtların araştırma merkezleriyle açıklığa kavuşturulmasını sağlıyorum. Yan etkilerin ve kullanılan ilaçların standart tıbbi sözlüklerle kodlanması, laboratuvar ve diğer dış kaynak verilerinin karşılaştırılması ve hasta bazlı açıklayıcı raporların hazırlanması da bu sürecin parçalarıdır.
Temizlenmiş ve doğrulanmış veriler; yan etkilerin görülme sıklığının değerlendirilmesine, tedavinin yarar ve risk dengesinin anlaşılmasına ve araştırma sonuçlarının bilimsel olarak yorumlanmasına temel oluşturur. Bu aşamada farmakovijilans ve güvenlilik raporlarının hazırlanmasına, yetkili otoritelere sunulacak veri ve açıklamaların oluşturulmasına, çalışma analiz raporlarına ve klinik araştırma sonuç raporunun yazımına katkı sağlıyorum. Amacım, araştırmanın sonunda alınacak kararların güvenilir, anlaşılır ve denetlenebilir verilere dayanmasını sağlamaktır.
Çalışma alanlarım ve araçlarım
Klinik veri yönetimiAntimikrobiyal dirençBiyofilm ve bakteriyofaj araştırmalarıKlinik Veri Değişim Standartları Konsorsiyumu (CDISC) ve Çalışma Verisi Tabülasyon Modeli (SDTM)Düzenleyici Faaliyetler için Tıbbi Sözlük (MedDRA) ve UMC İlaç Sözlüğü (WHODrug Global)IBM Sosyal Bilimler için İstatistik Paketi (SPSS), Stata ve GraphPad PrismKlinik araştırma deneyimimin kapsamı
2019’dan bu yana klinik araştırmaların veri ve analiz süreçlerinde; erken faz çalışmalardan gerçek yaşam verisi araştırmalarına kadar uzanan geniş bir portföyde görev aldım.
Klinik araştırmada veri yolculuğu
Çalışmanın amacı ve hedefleri doğrultusunda toplanacak veri alanları ile veri kalitesi kontrolleri belirlenir.
Elektronik hasta formları ile araştırma veri tabanı hazırlanır, sistem gerçek kullanım senaryolarıyla test edilir; araştırma boyunca eksik, çelişkili veya olağan dışı kayıtlar düzenli olarak incelenerek merkezlerle açıklığa kavuşturulur.
Yan etkiler, ilaçlar ve dış kaynak verileri kodlanır ve karşılaştırılır.
Doğrulanmış veriler analiz, güvenlilik ve sonuç raporlarına dönüşür.
Akademik tezler
Marmara Üniversitesi
Kocaeli Üniversitesi
The Journal of Infection in Developing Countries (JIDC) · Accepted for publication
B. M. Sarıtaş, A. Karacalı Tunç, M. Çotak, G. Alçi, N. Çeri, D. Ğezal
International Journal of Pharmacology 20: 1135-1142
E. Sayın, G. Alçi, A. Ozanat, N. Duman, A. Karahasan
Northern Clinics of Istanbul
A. Karahasan Yagci, G. Alci, M. M. Guncu, et al.
Infectious Diseases in Clinical Practice 31(3)
E. Fidan, G. Alçi, A. Karahasan
FLORA 28(2): 253-263
G. Alçi, S. A. Keçeli, B. M. Sarıtaş
Kocaeli University Journal of Health Sciences 8(1): 228-234
Ö. Demirkol, G. Alçi, B. Karadağ, Y. Gökdemir, E. Erdem Eralp, Ş. Karabulut, A. Karahasan
ANKEM 36(3): 125-132
G. Alçi, H. Bilgen, E. Özek, A. K. Yagci
International Journal of Research in Medical Sciences 9(12): 3534-3540
E. Fidan, G. Alçi, S. S. Koldaş, B. Karadağ, Y. Gökdemir, E. Erdem Eralp, A. Karahasan Yagcı
Journal of Pediatric Infectious Diseases 16(5): 242-246
G. Alçi, D. Güneşer, A. Güner, A. Karahasan
ANKEM 35(3): 70-76
A. Karahasan Yagci, G. Alci, C. Akin, A. Cakan, E. Sarioglu, et al.
JSM Allergy and Asthma 4(1): 1024
A. Karahasan Yagci, G. Alci, C. Akin, A. Cakan, E. Sarioglu, et al.
Authorea Preprints
Blog
Alanımdaki yöntemler, deneyimler ve güncel tartışmalar üzerine kısa yazılar hazırlıyorum.
Yakında
Yakında
Yakında
Sertifikalar ve eğitimler
Tamamladığım sertifika programları, mesleki eğitimler ve uluslararası öğrenim deneyimleri.
Konferanslar ve etkinlikler
Ulusal ve uluslararası bilimsel toplantılarda sunulan sözlü bildiriler ve posterler.
ORPHEUS Congress · Leuven, Belgium
013rd International Microbiota and Probiotic Microbiome Congress · Antalya
027th National Clinical Microbiology Congress · Antalya
0322nd Parasitology Congress
04TMC Online Microbiology Symposium
0529th ECCMID · Amsterdam
0627th National Neonatology Congress · Antalya
073rd Middle East Cystic Fibrosis Conference · Istanbul
083rd Middle East Cystic Fibrosis Conference · Istanbul
093rd Middle East Cystic Fibrosis Conference · Istanbul
103rd Middle East Cystic Fibrosis Conference · Istanbul
112nd Middle East Cystic Fibrosis Conference · Izmir
12VI Congress of Macedonian Microbiologists · Macedonia
13